1- ORGANISATION DES ENSEIGNEMENTS EN STS BIOANALYSES ET CONTROLES

Première année :

Deuxième année :

2- PROGRESSION 2008/2010 DU COURS DE BCM ET DES TP

2.1. Cours de biologie cellulaire et moléculaire

STS1 Bioanalyses et Contrôles (1 B-C)

Partie 1 : Etude des structures et ultrastructures cellulaires : méthodes d'étude de la cellule, membranes biologiques, compartiment cytosolique, mitochondries et peroxysomes, matériel génétique chez les Eucaryotes et les bactéries, ultrastructures spécifiques de la cellule végétale

Partie 2 : Les anticorps et la réaction antigène-anticorps in vitro : anticorps : structure et fonctions, obtention du réactif anticorps, réaction antigène – anticorps in vitro

Partie 3 : Biologie moléculaire : organisation moléculaire des génomes eucaryote et procaryote, réplication de l'ADN, transcription, traduction, modifications post-traductionnelles, mutations et mécanismes de réparation de l'ADN, transferts génétiques, génie génétique

STS2 Bioanalyses et Contrôles (2 B-C)

Partie 4 : Biologie cellulaire : cycle cellulaire et mort cellulaire, communications entre cellules eucaryotes par message chimique

Partie 5 : Biologie et physiologie végétales : anatomie végétale : les différents organes d'une plante, développement et multiplication végétative des végétaux, hormones végétales ou phytohormones, obtention de plantes transgéniques (OGM)

Partie 6 : Virus et agents transmissibles non conventionnels : caractères généraux des virus, multiplication des bactériophages, multiplication des virus eucaryotes, notions sur les agents transmissibles non conventionnels (ATNC)

Partie 7 : Pharmacologie et toxicologie : éléments de physiologie, méthodes d'étude et d'évaluation de la toxicité d'une substance, absorption, distribution et métabolisme des xénobiotiques, modes et sites d'action des médicaments - Notions de pharmacodynamie

2.2. TP de biologie cellulaire et moléculaire

1) Techniques de culture des cellules eucaryotes (STS2) : préparation et étude des cellules - obtention d'une culture primaire - conservation et entretien d'une lignée cellulaire - mise en évidence et quantification d'un effet cytotoxique sur des cellules en culture - obtention d'un vitroplant par micropropagation in vitro

2) Méthodes d'analyse utilisant des anticorps (STS1) : analyses fondées sur une réaction d'immunoagglutination ou d'immunoprécipitation - analyses faisant intervenir des anticorps marqués - purification d'une molécule par une méthode faisant intervenir des anticorps fixés

3) Techniques de biologie moléculaire (STS1 & 2) : extraction d'acides nucléiques - utilisation des endonucléases de restriction - amplification d'acides nucléiques par PCR - analyse de fragments nucléiques par électrophorèse - mise en œuvre d'une technique d'hybridation - mise en œuvre d'une analyse ou d'un contrôle. Détection par hybridation moléculaire

2.3. TP de microbiologie

1) Observation et culture des microorganismes (STS1) : techniques microscopiques - techniques de culture - techniques de conservation

2) Identification des microorganismes (STS1) : techniques microbiologiques classiques - techniques immunologiques - techniques de biologie moléculaire

3) Quantification et suivi de croissance (STS1) : techniques de quantification des microorganismes, étude du suivi de croissance en milieu non renouvelé

4) Etudes relatives aux agents antimicrobiens (STS1) : étude de la sensibilité des souches aux agents antimicrobiens - recherche et dosage d'un agent antimicrobien dans un bioproduit - contrôle de l'efficacité d'un conservateur - détermination de l'activité bactéricide d'un antiseptique et/ou désinfectant - évaluation de l'activité bactéricide de radiations UV

5) Contrôles microbiologiques (STS2) : contrôles de la qualité microbiologique des bioproduits - contrôles de stérilité - contrôles de pollution des locaux et contrôle de l'hygiène du personnel

6) Opérations unitaires de microbiologie (STS1 & 2) : réalisation d'une production en fermenteur pilote - réalisation d'une pasteurisation

2.4. TP de biochimie

1) Préparation et conservation des échantillons et produits (STS1 & 2) : broyage, homogénéisation, minéralisation, calcination, évaporation, dessiccation - centrifugation, filtration, ultrafiltration, précipitation, relargage, dialyse, sonication, distillation

2) Analyses gravimétriques et physicochimiques (STS1) : détermination des taux de matière sèche, cendres, % de matières organiques et minérales - détermination de l'activité de l'eau - détermination des caractéristiques rhéologiques d'un échantillon

3) Analyses volumétriques et électrochimiques (STS1 & 2) : méthodes chimiques : acidimétrie, oxydo-réduction - méthodes physiques : pHmétrie, potentiométrie, conductimétrie - électrodes spécifiques

4) Analyses mettant en œuvre des méthodes optiques (STS1 & 2) : polarimétrie, réfractométrie - spectrophotométrie d'absorption moléculaire : UV, visible, IR, IRTF - spectrophotométrie d'absorption atomique - spectrophotométrie d'émission moléculaire - spectrophotométrie d'émission atomique - photométrie des milieux troubles

5) Analyses mettant en œuvre des techniques chromatographiques (STS1) : CCM - chromatographie en phase liquide basse pression - HPLC - CPG

6) Analyses mettant en œuvre des techniques électrophorétiques (STS1 & 2) : électrophorèses sur support, SDS PAGE, en gel d'agarose - électrophorèses capillaire, électrofocalisation, bidimensionnelle - IEP

7) Analyses mettant en œuvre des techniques enzymatiques (STS1) : détermination d'activités enzymatiques - dosage des substrats par méthode enzymatique - capteurs enzymatiques

8) Analyses mettant en œuvre des techniques de biologie moléculaire (STS1 & 2) : extraction et digestion d'acides nucléiques - amplification d'acides nucléiques par PCR - analyse des produits d'amplification

9) Opérations unitaires (STS1 & 2) : ultrafiltration - formulation/émulsion